Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxd13P70217 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxd13P70217 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms