Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gabrb3P63080 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gabrb3P63080 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gabrb3P63080 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms