Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vsnl1P62761 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vsnl1P62761 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms