Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Rpl18aP62717 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rpl18aP62717 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms