Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rps11P62281 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rps11P62281 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rps11P62281 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms