Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrch1P62046 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrch1P62046 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms