Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lmo4P61969 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms