Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ufm1P61961 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms