Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smg6P61406 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg6P61406 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smg6P61406 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg6P61406 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg6P61406 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smg6P61406 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg6P61406 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg6P61406 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Smg6P61406 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 353.6 ms