Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem258P61166 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms