Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Scarf2P59222 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Scarf2P59222 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms