Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Csrnp3P59055 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms