Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Paxbp1P58501 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Paxbp1P58501 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms