Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dpf3P58269 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms