Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tm9sf2P58021 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tm9sf2P58021 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tm9sf2P58021 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf2P58021 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf2P58021 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf2P58021 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf2P58021 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf2P58021 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf2P58021 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tm9sf2P58021 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms