Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrpa1P57784 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms