Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtnsP57757 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtnsP57757 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CtnsP57757 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtnsP57757 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms