Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace1P56818 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace1P56818 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bace1P56818 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace1P56818 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace1P56818 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace1P56818 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms