Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cyp2c40P56657 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp2c40P56657 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c40P56657 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp2c40P56657 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms