Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc1a3P56564 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc1a3P56564 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms