Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gp1bbP56400 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gp1bbP56400 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms