Protein–RNA interactions for Protein: P56390

Cks2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cks2P56390 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cks2P56390 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cks2P56390 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cks2P56390 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cks2P56390 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms