Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GferP56213 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GferP56213 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GferP56213 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GferP56213 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GferP56213 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms