Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rad23bP54728 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rad23bP54728 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.7 ms