Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cacnb3P54285 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb3P54285 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms