Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RabggtbP53612 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RabggtbP53612 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms