Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux1P53564 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux1P53564 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cux1P53564 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux1P53564 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Cux1P53564 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cux1P53564 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cux1P53564 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cux1P53564 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux1P53564 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux1P53564 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms