Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fgd1P52734 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fgd1P52734 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms