Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Upp1P52624 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp1P52624 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp1P52624 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Upp1P52624 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Upp1P52624 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms