Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
XpcP51612 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
XpcP51612 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XpcP51612 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XpcP51612 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XpcP51612 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XpcP51612 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
XpcP51612 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
XpcP51612 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XpcP51612 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XpcP51612 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XpcP51612 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
XpcP51612 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XpcP51612 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XpcP51612 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XpcP51612 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XpcP51612 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XpcP51612 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
XpcP51612 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XpcP51612 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XpcP51612 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
XpcP51612 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
XpcP51612 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpcP51612 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpcP51612 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpcP51612 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpcP51612 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpcP51612 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpcP51612 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpcP51612 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpcP51612 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpcP51612 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
XpcP51612 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
XpcP51612 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XpcP51612 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XpcP51612 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XpcP51612 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XpcP51612 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XpcP51612 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XpcP51612 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
XpcP51612 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
XpcP51612 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
XpcP51612 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XpcP51612 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XpcP51612 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XpcP51612 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XpcP51612 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XpcP51612 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XpcP51612 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XpcP51612 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XpcP51612 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XpcP51612 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XpcP51612 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XpcP51612 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XpcP51612 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XpcP51612 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XpcP51612 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XpcP51612 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XpcP51612 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XpcP51612 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XpcP51612 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XpcP51612 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms