Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CastP51125 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CastP51125 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CastP51125 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CastP51125 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CastP51125 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CastP51125 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CastP51125 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CastP51125 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CastP51125 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CastP51125 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CastP51125 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CastP51125 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CastP51125 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CastP51125 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CastP51125 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CastP51125 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CastP51125 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CastP51125 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CastP51125 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CastP51125 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CastP51125 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CastP51125 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CastP51125 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CastP51125 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CastP51125 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CastP51125 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CastP51125 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CastP51125 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CastP51125 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CastP51125 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CastP51125 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CastP51125 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CastP51125 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CastP51125 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms