Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TspoP50637 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TspoP50637 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TspoP50637 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TspoP50637 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TspoP50637 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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