Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SftpdP50404 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SftpdP50404 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SftpdP50404 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms