Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc13P50207 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms