Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtshP49935 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtshP49935 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CtshP49935 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtshP49935 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtshP49935 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtshP49935 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtshP49935 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtshP49935 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtshP49935 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtshP49935 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtshP49935 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtshP49935 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CtshP49935 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtshP49935 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtshP49935 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CtshP49935 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtshP49935 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CtshP49935 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtshP49935 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtshP49935 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtshP49935 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtshP49935 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtshP49935 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtshP49935 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtshP49935 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtshP49935 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtshP49935 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtshP49935 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtshP49935 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtshP49935 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtshP49935 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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