Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfbP49766 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VegfbP49766 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfbP49766 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfbP49766 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfbP49766 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfbP49766 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfbP49766 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfbP49766 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VegfbP49766 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms