Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epb42P49222 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb42P49222 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb42P49222 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Epb42P49222 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms