Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ercc3P49135 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ercc3P49135 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms