Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CitP49025 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CitP49025 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CitP49025 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CitP49025 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CitP49025 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CitP49025 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CitP49025 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CitP49025 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CitP49025 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CitP49025 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CitP49025 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CitP49025 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CitP49025 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CitP49025 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CitP49025 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CitP49025 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CitP49025 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CitP49025 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CitP49025 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CitP49025 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CitP49025 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CitP49025 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CitP49025 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CitP49025 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CitP49025 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CitP49025 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CitP49025 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CitP49025 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CitP49025 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CitP49025 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CitP49025 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CitP49025 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CitP49025 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CitP49025 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CitP49025 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CitP49025 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CitP49025 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CitP49025 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CitP49025 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CitP49025 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CitP49025 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CitP49025 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CitP49025 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CitP49025 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CitP49025 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CitP49025 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CitP49025 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CitP49025 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CitP49025 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CitP49025 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CitP49025 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CitP49025 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CitP49025 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CitP49025 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CitP49025 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CitP49025 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CitP49025 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CitP49025 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms