Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Igfbp6P47880 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igfbp6P47880 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms