Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrprbP47758 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SrprbP47758 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrprbP47758 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrprbP47758 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms