Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TesP47226 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TesP47226 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TesP47226 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TesP47226 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TesP47226 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TesP47226 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TesP47226 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TesP47226 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TesP47226 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TesP47226 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TesP47226 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TesP47226 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TesP47226 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TesP47226 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TesP47226 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TesP47226 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TesP47226 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TesP47226 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TesP47226 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TesP47226 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms