Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgavP43406 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgavP43406 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgavP43406 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgavP43406 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgavP43406 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgavP43406 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgavP43406 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ItgavP43406 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms