Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtgfrP43117 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PtgfrP43117 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms