Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NodalP43021 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NodalP43021 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NodalP43021 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
NodalP43021 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NodalP43021 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NodalP43021 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NodalP43021 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NodalP43021 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NodalP43021 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms