Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LtbP41155 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LtbP41155 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LtbP41155 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LtbP41155 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LtbP41155 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LtbP41155 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LtbP41155 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LtbP41155 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbP41155 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbP41155 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbP41155 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbP41155 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbP41155 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbP41155 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbP41155 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbP41155 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LtbP41155 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LtbP41155 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LtbP41155 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LtbP41155 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms