Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VhlP40338 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VhlP40338 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VhlP40338 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VhlP40338 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VhlP40338 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VhlP40338 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VhlP40338 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VhlP40338 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VhlP40338 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VhlP40338 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VhlP40338 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VhlP40338 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VhlP40338 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VhlP40338 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VhlP40338 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VhlP40338 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VhlP40338 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VhlP40338 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VhlP40338 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VhlP40338 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VhlP40338 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VhlP40338 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VhlP40338 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VhlP40338 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VhlP40338 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VhlP40338 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VhlP40338 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VhlP40338 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VhlP40338 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VhlP40338 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VhlP40338 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VhlP40338 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VhlP40338 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms