Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col18a1P39061 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col18a1P39061 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col18a1P39061 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms