Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ly6fP35460 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ly6fP35460 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms