Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpoP35419 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TpoP35419 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TpoP35419 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TpoP35419 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TpoP35419 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TpoP35419 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TpoP35419 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TpoP35419 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TpoP35419 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TpoP35419 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TpoP35419 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TpoP35419 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TpoP35419 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TpoP35419 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TpoP35419 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TpoP35419 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TpoP35419 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TpoP35419 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TpoP35419 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TpoP35419 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms